Quantum Composers脉冲发生器有两种模式选择：系统模式和通道模式。将这两种模式结合起来，就可以由一个单元产生复杂的脉冲序列。大多数Quantum Composers脉冲发生器包含系统和通道模式设置，以提供提供全面的脉冲产生解决方案。
系统模式由单元生成，然后分布到每个单独的通道。可用的系统模式有连续、单次触发、突发和占空比。连续模式产生连续的脉冲流，脉冲流从按下运行/停止按钮（或触发器输入）开始，在第二次按下运行/停止按钮时结束。当按下run/stop（运行/停止）按钮（或触发装置）时，单发模式将产生一个单一输出脉冲，当脉冲结束时，系统将自动解除防护。突发模式将产生预先确定数量的脉冲，然后在这些脉冲完成时解除系统武装。占空比产生一系列“开”脉冲和一系列“关”脉冲，其中“开”和“关”脉冲由用户设置。下面的图1显示了所有可用系统模式的合成图像。
除正常模式取代连续模式外，通道模式与系统模式相同。当通道处于正常模式时，输出将是系统设置的任何值。在通道级别上，一个更重要的变化是通道不会重新武装自己。例如，当系统设置为正常，通道A设置为单脉冲时，即使系统仍处于待命状态并且正在积极地产生脉冲，通道A也只输出一个脉冲。当通道模式设置为突发时，会显示相同的行为。一旦达到定义的脉冲数，即使系统仍处于待命和运行状态，输出也将不再产生脉冲。考虑这两种模式之间的交互作用的一个简单方法是，当系统向通道馈送信号时，考虑它。无论系统设置为什么，都会进入所有通道，然后通道会进一步限制输出。
图2显示了系统模式及其与通道模式的关系的图示。在这个图中，通道模式限制了输出。
与图2相比，图3显示了系统模式（突发=3）限制输出的示例
注意，在图2中，即使通道突发模式设置为5，也只输出3个脉冲。如果通道模式设置为占空比，则会看到类似的效果。输出将由这两种模式中限制性更强的模式生成。如果系统模式设置为连续且通道模式为突发，则只会产生脉冲突发，因此输出受通道模式限制。如果系统模式设置为突发且通道模式正常，则只会生成突发，但此时输出受系统模式设置的限制。虽然由上述两个例子产生的输出是相同的（脉冲串），但有一些细微的差别。
在第一个例子中，当系统被设置为连续并且通道被设置为突发时，脉冲的输出设置将只出现一次，但是系统运行指示灯将继续闪烁。（注意：系统运行指示灯是位于显示器左上角的一个闪烁圆圈）在此配置中，按下功能（FUNC）按钮，然后按下运行/停止按钮，可以重新设置通道。当系统设置为连续且通道为限制器时，一个通道可以保持正常，而第二个通道可以设置为突发或单次发射。这种两级结构允许生成其他脉冲发生器无法实现的复杂脉冲输出。
在第二个例子中，系统设置为突发，通道设置为正常，脉冲输出设置将出现一次，但此时系统运行指示灯将停止闪烁。要重新启用第二组脉冲的输出，必须再次按下运行/停止按钮。一旦第二组脉冲完成，系统输出将再次关闭。
这种控制方式有用的一个应用是闪光灯泵浦激光器的操作。当系统设置为连续时，一个通道可以设置为正常（控制闪光灯），第二个通道可以设置为单点（Q开关控制）。系统周期将被设置为激光器所需的频率，单次发射通道将控制激光器的实际输出。这使得激光闪光灯可以继续运行，而无需实际启动激光输出。独立的通道延迟也可以修改以优化激光器的输出性能。
当使用频道模式时，重要的是要注意哪些模式将出现一次，哪些模式将以连续的方式运行。单发模式和突发模式将出现一次，系统需要重新装备（FUNC后接RUN/STOP），然后才能出现第二个输出。按下运行/停止按钮后，通道正常模式和工作循环模式将连续运行。
每个输出只能设置一个通道模式，但所有输出彼此独立，因此可以在一台仪器上设置多个通道模式。通道独立和两级模式允许在单个单元上有多种输出。
