美国Charles Supper 超蛋白丝模型折弯机 Cat.#7145

 

美国Charles Supper 超蛋白丝模型折弯机 Cat.#7145

Catalog # 7145

超蛋白丝模型折弯机

 

超级蛋白质金属丝模型折弯机,也被称为拜伦折弯机,将制作单件蛋白质α-碳模型。

Super-Protein Wire Model Bender(超级蛋白丝模型折弯机)是一种通过在一根连续长度的钢棒中放置适当的折弯来轻松制作蛋白质分子的α-碳骨架模型的设备。这些模型可以按任何比例制作,缩小到大约4mm/Å。在这种规模下,模型可以完全独立,因此不需要外部支持网络。它们足够小,只需要很少的存储空间,足够坚固,能够经受住频繁的搬运和研究。
目前已经有好几种类型的蛋白质模型可用,但它们都涉及将大量小片段精确地连接在一起,因此构建的成本和难度限制了它们的使用。幸运的是,bender生产的简单的单件蛋白质模型可以实现许多功能,三维模型对这些功能最有价值。它们异常清晰地展示了每种蛋白质的整体折叠模式,特别适合于比较一个分子内或同源蛋白质之间结构相似的区域。通过在主链上添加配体和一些选定的侧链,这些模型显示了酶活性位点的三维几何结构,这在生化实验的设计中通常很有用。这些骨干模型对于教学目的很有用,无论是作为课堂展示还是作为实验室练习,学生可以制作自己的蛋白质模型进行学习和保存。由于这些模型很小,而且可以快速构建,因此构建每个已知蛋白质结构的模型是可行的。

这款弯管机由杜克大学的Byron H. Rubin和 Jane S. Richardson(获得美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)的资助,通用汽车公司Grant GM 15000)。

图(1)Rubredoxin,显示了铁原子及其四个半胱氨酸配体。该模型由1/8″的钢棒弯曲并镀镍。它大约有五英寸高,比例为4mm/Å。

构建蛋白质α-碳模型的折弯机如下所示。该仪器由三个基本元件组成:一套两个杆夹、一个旋转铁砧和一个直读弯曲锤。0.125的固定长度“或通过接合移动夹钳,分离固定夹钳,并将移动夹钳向前移动至停止位置,将3mm的钢条送入弯曲砧座。坐标系由距离、二面角和沿蛋白质主链的每个残余物的弯曲角组成。连续α碳Cn-1和Cn之间的距离由测微计设置确定。始终将杆固定在两个杆夹中的至少一个中,可以相对于折弯机测量二面角,作为固定的参考框架。如果An’是Cn-2Cn-1Cn平面和Cn-1CnCn+1平面之间的局部二面角,则弯曲砧筒刻度盘上显示的累积二面角An为

通过弯曲锤刻度盘上读取的弯曲角度Bn弯曲杆,稍微过冲以允许钢杆的弹性。

 

为了确保仪器寿命,弯曲砧和锤子以及其他受应力的零件已硬化至洛氏45。

 

装运时,每个折弯机都提供了说明材料。详细描述了弯曲模型的过程。列出了十种蛋白质(胰岛素、红细胞氧还蛋白、胰蛋白酶抑制剂、高电位铁蛋白、细胞色素b5、细胞色素C、鲤鱼肌原、葡萄球菌核酸酶、碳酸酐酶和乳酸脱氢酶)的弯曲角度列表,并提供了自1972年5月以来已发表的蛋白质坐标集的文献参考。

 

图(2)核糖核酸酶S:S蛋白和S肽的主链位于1/8“钢棒中,二硫键位于1/16”金属丝中。该模型由折弯机制成,尺寸为6毫米/Å,直径约10英寸。(点击查看图)

 


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