美国Charles Supper超蛋白质线模型折弯机,Supper蛋白质线模型弯曲机 Cat.#7145

Supper Protein Wire Model Bender,也称为 Byron’s Bender,将制作一体式蛋白质 α-碳模型

Supper Protein Wire Model Bender是一种通过将适当的弯曲放入一根连续长度的钢棒中轻松制作蛋白质分子的 α-碳骨架模型的设备。这些模型可以按任何比例制作,小至约 4mm/Å。在这种尺寸下,模型可以完全独立,因此不需要额外的支持网络。它们足够小,只需要很少的存储空间,并且足够坚固,可以经受住频繁的处理和研究。

已经有几种好的蛋白质模型可供使用,但它们都涉及将大量小块精确地连接在一起,因此构建的费用和难度限制了它们的使用。 幸运的是,弯曲机制作的简单的一体式蛋白质模型可以提供许多三维模型最有价值的功能. 它们以异常清晰的方式展示了每种蛋白质的整体折叠模式,特别适用于比较一个分子内或同源蛋白质之间结构相似的区域。通过将配体和一些选定的侧链添加到主链中,这些模型显示了酶活性位点的三维几何形状,这在生化实验设计中通常很有用。这些骨干模型可用于教学目的,既可作为课堂展览,也可作为实验室练习,学生可以在其中制作自己的蛋白质模型以进行学习和保存。由于这些模型很小并且可以快速构建,因此构建每种已知蛋白质结构的模型是切实可行的。

该弯管机由杜克大学的 Byron H. Rubin 和 Jane S. Richardson 开发(在美国国立卫生研究院的支持下,Grant GM 15000)。

图(1)红氧还蛋白,显示铁原子及其四个半胱氨酸配体。该模型由 1/8 英寸钢棒弯曲并镀镍。它高约 5 英寸,比例为 4 毫米/埃。

用于构建蛋白质 α-碳模型的弯曲机如下所示。该仪器由三个基本元件组成:一组两个杆夹、一个旋转砧和一个直读弯锤。固定长度的 0.125″ 或 3mm 钢棒通过折弯砧通过接合移动夹具、脱离固定夹具并将移动夹具推进到前进挡块。坐标系由距离、二面角和沿蛋白质骨架的每个残基的弯曲角。连续 α-碳 C n-1和 C n之间的距离由千分尺设置确定。始终将杆保持在两个杆夹中的至少一个中允许二面角相对于作为固定参考系的折弯机进行测量。如果 A n‘为C n-2 C n-1 C n平面与C n-1 C n C n+1平面之间的局部二面角,则弯砧鼓刻度盘上标明的累积二面角A n


为 杆以弯曲角度Bn弯曲,该角度在弯曲锤刻度盘上读取,带有轻微的过冲量以允许钢棒的弹性。

为确保仪器的使用寿命,弯曲砧和锤子以及其他承受应力的部件都已硬化至 Rockwell 45。

每个弯管机在发货时都提供说明材料。详细描述了弯曲模型的过程。包括十种蛋白质(胰岛素、红氧还蛋白、胰蛋白酶抑制剂、高电位铁蛋白、细胞色素 b5、细胞色素 C、鲤鱼肌原、葡萄球菌核酸酶、碳酸酐酶和乳酸脱氢酶)的弯曲角度列表,并为这些蛋白质提供了参考文献截至 1972 年 5 月出版的蛋白质坐标集。

图(2)核糖核酸酶S:1/8”钢棒中S蛋白和S肽的骨架和1/16”钢丝中的二硫键。该模型由弯曲机制成,尺寸为 6 毫米/埃,宽约 10 英寸。


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