美国Charles Supper薄壁毛细管,超蛋白线材模型折弯机

Charles Supper  公司 超蛋白线材模型折弯机


超级蛋白质丝模型弯曲机,
也被称为拜伦的弯曲机,
可以制作一个整体的蛋白质-碳模型。

超蛋白线材模型折弯机是一种易于加工的设备α-通过在一
根连续长度的钢棒上放置适当的弯曲度来建立蛋白质分子
的碳骨架模型。该模型可以在任何规模缩小到约4毫米/Å.
在这种尺寸下,模型可以完全独立,因此不需要外部支持
的网络。它们足够小,只需要很少的存储空间,足够坚固,
能够经受住频繁的搬运和研究。
目前已经有好几种类型的蛋白质模型,但是它们都需要精确
地将大量的小片段连接在一起,因此构建的成本和难度限制
了它们的使用。幸运的是,bender产生的简单的单件蛋白质
模型可以服务于三维模型最有价值的许多功能。它们以异常
清晰的方式展示了每个蛋白质的整体折叠模式,特别适合于
比较一个分子内或同源蛋白质之间结构相似的区域。这些模
型通过在骨架上添加配体和一些选定的侧链,展示了酶活性
位点的三维几何结构,这在生化实验设计中是非常有用的。
这些骨干模型对于教学非常有用,既可以作为课堂展示,也
可以作为学生制作自己的蛋白质模型以供学习和保存的实验
室练习。由于这些模型很小,而且可以快速构建,因此建立
每个已知蛋白质结构的模型是可行的。

弯刀是由Byron H. Rubin和Jane S. Richardson在杜克大学
开发的(在美国国家卫生研究院的支持下,Grant GM 15000)。

图(1)红发蛋白,显示铁原子及其四种半胱氨酸配体。模型是弯
从1/8 “钢棒和镀镍。它大约5英寸高,比例尺为4毫米/Å。

构建蛋白α-碳模型的弯折如下图所示。该仪器由三个基本元素
组成:一组两个杆夹,一个旋转铁砧,和一个直读弯锤。通过接
合动夹,脱离固定夹,向前推进动夹,通过弯砧送出固定长度
0.125″或3mm的钢条。该坐标系由沿蛋白质主干的每个残基的
一个距离、一个二面角和一个弯曲角组成。连续的α -碳Cn-1和
Cn之间的距离由千分尺设置确定。始终保持杆在至少一个两个
杆夹允许二面角相对弯曲作为一个固定的参考系被测量。如果
An ‘是Cn-2Cn-1Cn面与Cn-1CnCn+1面之间的局部二面角,
则弯砧鼓表盘上显示的累积二面角An为

在弯曲锤表盘上读取弯曲角度Bn,并略微超调以保证钢棒的弹性。

为了保证仪器的使用寿命,弯曲砧和锤子以及其他受应力的零件已硬化洛氏45。

说明材料提供与每个弯管机时,装运。详细描述了弯曲模型的制
作过程。弯曲角度列表包括十个蛋白质(胰岛素,红蛋白,胰蛋白
酶抑制剂,高潜力铁蛋白,细胞色素b5,细胞色素C,鲤鱼肌原,
葡萄球菌核酸酶,碳酸酐酶,乳酸脱氢酶),并给出了截至1972年
5月出版的蛋白质坐标的文献参考。

图(2)核糖核酸酶S: S蛋白和S肽的主干在1/8”钢棒和1/16”丝的
二硫键。模型是用弯管机制作的,尺寸为6毫米/Å,直径约为10英寸。


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